Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LETMD1Q6P1Q0 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms