Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZI2

CAVIN1, Caveolae-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN1Q6NZI2 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAVIN1Q6NZI2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms