Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF9

RHBDD2, Rhomboid domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD2Q6NTF9 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHBDD2Q6NTF9 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms