Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms