Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms