Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P8

SYT6, Synaptotagmin-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6Q5T7P8 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SYT6Q5T7P8 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT6Q5T7P8 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT6Q5T7P8 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT6Q5T7P8 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT6Q5T7P8 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT6Q5T7P8 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT6Q5T7P8 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT6Q5T7P8 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT6Q5T7P8 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT6Q5T7P8 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT6Q5T7P8 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT6Q5T7P8 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT6Q5T7P8 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT6Q5T7P8 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT6Q5T7P8 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT6Q5T7P8 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT6Q5T7P8 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT6Q5T7P8 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT6Q5T7P8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT6Q5T7P8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT6Q5T7P8 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT6Q5T7P8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT6Q5T7P8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT6Q5T7P8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT6Q5T7P8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT6Q5T7P8 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT6Q5T7P8 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT6Q5T7P8 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT6Q5T7P8 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT6Q5T7P8 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT6Q5T7P8 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT6Q5T7P8 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT6Q5T7P8 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT6Q5T7P8 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT6Q5T7P8 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYT6Q5T7P8 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYT6Q5T7P8 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYT6Q5T7P8 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYT6Q5T7P8 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYT6Q5T7P8 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYT6Q5T7P8 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYT6Q5T7P8 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYT6Q5T7P8 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYT6Q5T7P8 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYT6Q5T7P8 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms