Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms