Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms