Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
KHDC3LQ587J8 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
KHDC3LQ587J8 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms