Protein–RNA interactions for Protein: Q49AH0

CDNF, Cerebral dopamine neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDNFQ49AH0 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDNFQ49AH0 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms