Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms