Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NBPF1Q3BBV0 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms