Protein–RNA interactions for Protein: Q32NC0

C18orf21, UPF0711 protein C18orf21, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf21Q32NC0 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms