Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWA4

SKOR2, SKI family transcriptional corepressor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR2Q2VWA4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKOR2Q2VWA4 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms