Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGSM1Q2NKQ1 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms