Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC27Q2M243 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms