Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MSMPQ1L6U9 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
MSMPQ1L6U9 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms