Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
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