Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IMPG1Q17R60 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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