Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDO1Q16878 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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CDO1Q16878 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDO1Q16878 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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