Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRNQ16849 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRNQ16849 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRNQ16849 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRNQ16849 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRNQ16849 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRNQ16849 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRNQ16849 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRNQ16849 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRNQ16849 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRNQ16849 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRNQ16849 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRNQ16849 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRNQ16849 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRNQ16849 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRNQ16849 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRNQ16849 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRNQ16849 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRNQ16849 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRNQ16849 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRNQ16849 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRNQ16849 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRNQ16849 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRNQ16849 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRNQ16849 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRNQ16849 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRNQ16849 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRNQ16849 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTPRNQ16849 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTPRNQ16849 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTPRNQ16849 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTPRNQ16849 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTPRNQ16849 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRNQ16849 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRNQ16849 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRNQ16849 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRNQ16849 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRNQ16849 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRNQ16849 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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PTPRNQ16849 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRNQ16849 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRNQ16849 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRNQ16849 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
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PTPRNQ16849 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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PTPRNQ16849 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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PTPRNQ16849 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRNQ16849 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRNQ16849 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRNQ16849 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
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PTPRNQ16849 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRNQ16849 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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PTPRNQ16849 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRNQ16849 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRNQ16849 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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PTPRNQ16849 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRNQ16849 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRNQ16849 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRNQ16849 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRNQ16849 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRNQ16849 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRNQ16849 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRNQ16849 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRNQ16849 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRNQ16849 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRNQ16849 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRNQ16849 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRNQ16849 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRNQ16849 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRNQ16849 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRNQ16849 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRNQ16849 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRNQ16849 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRNQ16849 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRNQ16849 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRNQ16849 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
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