Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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NDUFA9Q16795 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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NDUFA9Q16795 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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NDUFA9Q16795 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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NDUFA9Q16795 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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NDUFA9Q16795 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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NDUFA9Q16795 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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NDUFA9Q16795 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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NDUFA9Q16795 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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NDUFA9Q16795 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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NDUFA9Q16795 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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