Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
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