Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NTRK2Q16620 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms