Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ECM1Q16610 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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ECM1Q16610 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
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ECM1Q16610 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
ECM1Q16610 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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