Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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