Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNCBQ16143 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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