Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
TAF1CQ15572 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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