Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BRD3Q15059 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
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BRD3Q15059 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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BRD3Q15059 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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BRD3Q15059 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
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