Protein–RNA interactions for Protein: Q15021

NCAPD2, Condensin complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,401 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD2Q15021 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCAPD2Q15021 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
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