Protein–RNA interactions for Protein: Q14517

FAT1, Protocadherin Fat 1, humanhuman

Predictions only

Length 4,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT1Q14517 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
FAT1Q14517 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
FAT1Q14517 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
FAT1Q14517 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
FAT1Q14517 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
FAT1Q14517 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
FAT1Q14517 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
FAT1Q14517 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
FAT1Q14517 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
FAT1Q14517 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
FAT1Q14517 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
FAT1Q14517 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
FAT1Q14517 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
FAT1Q14517 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
FAT1Q14517 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
FAT1Q14517 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
FAT1Q14517 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
FAT1Q14517 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
FAT1Q14517 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
FAT1Q14517 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
FAT1Q14517 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
FAT1Q14517 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
FAT1Q14517 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
FAT1Q14517 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
FAT1Q14517 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
FAT1Q14517 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
FAT1Q14517 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
FAT1Q14517 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
FAT1Q14517 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
FAT1Q14517 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
FAT1Q14517 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
FAT1Q14517 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
FAT1Q14517 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
FAT1Q14517 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
FAT1Q14517 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
FAT1Q14517 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
FAT1Q14517 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
FAT1Q14517 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
FAT1Q14517 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
FAT1Q14517 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
FAT1Q14517 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
FAT1Q14517 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
FAT1Q14517 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
FAT1Q14517 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
FAT1Q14517 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
FAT1Q14517 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
FAT1Q14517 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
FAT1Q14517 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
FAT1Q14517 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
FAT1Q14517 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
FAT1Q14517 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
FAT1Q14517 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
FAT1Q14517 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
FAT1Q14517 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
FAT1Q14517 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
FAT1Q14517 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
FAT1Q14517 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
FAT1Q14517 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
FAT1Q14517 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
FAT1Q14517 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
FAT1Q14517 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
FAT1Q14517 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
FAT1Q14517 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC11.4□□□□□ -0.58
FAT1Q14517 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
FAT1Q14517 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
FAT1Q14517 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
FAT1Q14517 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
FAT1Q14517 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
FAT1Q14517 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
FAT1Q14517 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
FAT1Q14517 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
FAT1Q14517 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
FAT1Q14517 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
FAT1Q14517 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
FAT1Q14517 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
FAT1Q14517 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
FAT1Q14517 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
FAT1Q14517 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
FAT1Q14517 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
FAT1Q14517 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
FAT1Q14517 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
FAT1Q14517 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
FAT1Q14517 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
FAT1Q14517 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
FAT1Q14517 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
FAT1Q14517 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
FAT1Q14517 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
FAT1Q14517 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
FAT1Q14517 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
FAT1Q14517 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
FAT1Q14517 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
FAT1Q14517 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
FAT1Q14517 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
FAT1Q14517 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
FAT1Q14517 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
FAT1Q14517 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
FAT1Q14517 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
FAT1Q14517 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
FAT1Q14517 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
FAT1Q14517 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms