Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BECN1Q14457 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms