Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CBFBQ13951 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
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