Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
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