Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FHL3Q13643 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
FHL3Q13643 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
FHL3Q13643 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
FHL3Q13643 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms