Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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NAE1Q13564 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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NAE1Q13564 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
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NAE1Q13564 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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NAE1Q13564 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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NAE1Q13564 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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NAE1Q13564 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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NAE1Q13564 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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NAE1Q13564 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
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