Protein–RNA interactions for Protein: Q13557

CAMK2D, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2DQ13557 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms