Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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