Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MKRN4PQ13434 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 SLC8A1-AS1-218ENST00000610721 956 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 AC011451.1-201ENST00000591336 405 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 AL157938.2-207ENST00000415391 884 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
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