Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATMQ13315 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATMQ13315 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATMQ13315 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATMQ13315 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATMQ13315 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATMQ13315 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ATMQ13315 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATMQ13315 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATMQ13315 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATMQ13315 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ATMQ13315 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATMQ13315 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATMQ13315 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ATMQ13315 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATMQ13315 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATMQ13315 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATMQ13315 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATMQ13315 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ATMQ13315 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATMQ13315 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATMQ13315 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATMQ13315 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATMQ13315 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ATMQ13315 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATMQ13315 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ATMQ13315 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ATMQ13315 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATMQ13315 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATMQ13315 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ATMQ13315 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATMQ13315 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATMQ13315 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATMQ13315 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATMQ13315 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATMQ13315 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATMQ13315 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATMQ13315 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATMQ13315 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATMQ13315 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATMQ13315 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATMQ13315 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATMQ13315 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATMQ13315 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATMQ13315 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATMQ13315 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATMQ13315 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATMQ13315 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATMQ13315 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATMQ13315 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATMQ13315 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATMQ13315 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATMQ13315 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ATMQ13315 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ATMQ13315 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATMQ13315 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ATMQ13315 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATMQ13315 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATMQ13315 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATMQ13315 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATMQ13315 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATMQ13315 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATMQ13315 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATMQ13315 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATMQ13315 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATMQ13315 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATMQ13315 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATMQ13315 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATMQ13315 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATMQ13315 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATMQ13315 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ATMQ13315 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATMQ13315 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATMQ13315 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATMQ13315 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ATMQ13315 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATMQ13315 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATMQ13315 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATMQ13315 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ATMQ13315 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATMQ13315 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATMQ13315 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATMQ13315 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATMQ13315 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATMQ13315 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATMQ13315 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATMQ13315 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATMQ13315 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATMQ13315 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATMQ13315 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ATMQ13315 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATMQ13315 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATMQ13315 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATMQ13315 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATMQ13315 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ATMQ13315 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATMQ13315 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATMQ13315 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATMQ13315 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATMQ13315 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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