Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAF1Q13077 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAF1Q13077 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAF1Q13077 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAF1Q13077 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRAF1Q13077 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRAF1Q13077 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAF1Q13077 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAF1Q13077 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRAF1Q13077 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRAF1Q13077 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TRAF1Q13077 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TRAF1Q13077 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
TRAF1Q13077 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TRAF1Q13077 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAF1Q13077 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAF1Q13077 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRAF1Q13077 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRAF1Q13077 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAF1Q13077 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAF1Q13077 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRAF1Q13077 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAF1Q13077 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAF1Q13077 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAF1Q13077 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAF1Q13077 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAF1Q13077 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAF1Q13077 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAF1Q13077 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAF1Q13077 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAF1Q13077 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRAF1Q13077 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAF1Q13077 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAF1Q13077 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAF1Q13077 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAF1Q13077 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAF1Q13077 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAF1Q13077 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAF1Q13077 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAF1Q13077 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAF1Q13077 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAF1Q13077 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAF1Q13077 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAF1Q13077 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAF1Q13077 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAF1Q13077 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAF1Q13077 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAF1Q13077 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAF1Q13077 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAF1Q13077 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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TRAF1Q13077 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRAF1Q13077 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAF1Q13077 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAF1Q13077 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAF1Q13077 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAF1Q13077 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAF1Q13077 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAF1Q13077 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
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TRAF1Q13077 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAF1Q13077 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAF1Q13077 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAF1Q13077 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAF1Q13077 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRAF1Q13077 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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TRAF1Q13077 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAF1Q13077 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAF1Q13077 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAF1Q13077 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAF1Q13077 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAF1Q13077 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAF1Q13077 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
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TRAF1Q13077 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAF1Q13077 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAF1Q13077 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAF1Q13077 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAF1Q13077 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAF1Q13077 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAF1Q13077 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAF1Q13077 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAF1Q13077 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
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