Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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