Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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