Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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