Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRJQ12913 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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PTPRJQ12913 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
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PTPRJQ12913 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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PTPRJQ12913 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20■□□□□ 0.79
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PTPRJQ12913 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
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PTPRJQ12913 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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