Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
NFIAQ12857 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
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NFIAQ12857 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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NFIAQ12857 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
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NFIAQ12857 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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NFIAQ12857 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
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NFIAQ12857 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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NFIAQ12857 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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NFIAQ12857 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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NFIAQ12857 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
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NFIAQ12857 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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