Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms