Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FMODQ06828 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FMODQ06828 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FMODQ06828 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FMODQ06828 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FMODQ06828 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FMODQ06828 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FMODQ06828 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FMODQ06828 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FMODQ06828 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FMODQ06828 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FMODQ06828 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FMODQ06828 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FMODQ06828 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FMODQ06828 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FMODQ06828 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FMODQ06828 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FMODQ06828 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FMODQ06828 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FMODQ06828 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FMODQ06828 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FMODQ06828 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FMODQ06828 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FMODQ06828 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FMODQ06828 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FMODQ06828 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FMODQ06828 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FMODQ06828 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FMODQ06828 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FMODQ06828 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FMODQ06828 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FMODQ06828 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FMODQ06828 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FMODQ06828 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FMODQ06828 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FMODQ06828 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FMODQ06828 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FMODQ06828 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FMODQ06828 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FMODQ06828 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FMODQ06828 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FMODQ06828 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FMODQ06828 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FMODQ06828 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FMODQ06828 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FMODQ06828 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FMODQ06828 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FMODQ06828 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FMODQ06828 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FMODQ06828 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FMODQ06828 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FMODQ06828 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FMODQ06828 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FMODQ06828 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FMODQ06828 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FMODQ06828 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FMODQ06828 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FMODQ06828 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FMODQ06828 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FMODQ06828 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FMODQ06828 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FMODQ06828 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FMODQ06828 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FMODQ06828 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FMODQ06828 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FMODQ06828 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FMODQ06828 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FMODQ06828 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FMODQ06828 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FMODQ06828 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FMODQ06828 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FMODQ06828 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FMODQ06828 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FMODQ06828 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FMODQ06828 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FMODQ06828 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FMODQ06828 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FMODQ06828 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FMODQ06828 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FMODQ06828 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FMODQ06828 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FMODQ06828 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FMODQ06828 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FMODQ06828 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FMODQ06828 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FMODQ06828 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FMODQ06828 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FMODQ06828 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FMODQ06828 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FMODQ06828 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FMODQ06828 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FMODQ06828 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FMODQ06828 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FMODQ06828 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FMODQ06828 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FMODQ06828 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FMODQ06828 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FMODQ06828 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FMODQ06828 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FMODQ06828 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms