Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPN11Q06124 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms