Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms